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[科技日報]首個油菜基因轉錄數據庫建立

發布時間:2020-08-03 08:27:00 作者:瞿劍 來源:科技日報 2020年7月31日 瀏覽量:

  據中國農☉科院最新消息,該院油料作物研究所油料作物基因組學與抗病性改良創新團隊,破譯了油菜基因組的全轉錄信息密碼,構建了油避免有可疑人物出现菜十萬余個基因的轉錄▓全景圖,使身上得油菜基因功能研究第一次有了標準的可參考的基因轉錄數據Ψ 庫,將有力支撐油菜功能基因的相關研究。相關研究▓成果新近在線發表於《植物學報(The Plant Journal)》。

油菜功能基因轉錄信息實例圖

  團隊首席科學家、中國農科院油料所研究員劉勝毅介紹,油菜基因組包含約12億個堿基和十余萬個』基因。如何解讀這些海量的基因組信息,是功能↑基因研究的重要任務。根據中「心法則,基因通過轉錄形成mRNA再翻譯成蛋白質;由於基因的轉錄通常存在多種可變的剪切方◆式,從而一個基因可以形成許多種不同的mRNA。此前,由於技術和資源的限制,油菜一直缺乏全基因組水平有着不可逾越所有基因的轉錄mRNA數據庫,導致油▆菜基因功能研究缺乏可查詢和●可參考的基因註釋信息。

  為●突破這一瓶頸,團隊采用最新的三代測序技術準確測定了油菜全長ξ轉錄組,並自主開發了一套用於多倍體油菜復雜基因組的分型方法,繪制了油菜基因組的轉錄全景圖,構建了油菜“標準”的參考轉錄本數據庫↘。該研究成果更回应了下新了人們對油菜基因和基因組的認識和理解,將為甘藍型油菜功能◢基因和遺傳改良研究及基因組設計育種提供數據砰——砰——在飞奔基礎和理論指〖導。

  研究得到國家重點研發計劃項目、國家自然科學基金項目和中國農科院科技創新工程等資◥助。

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